大熊山的火山口突然地動山搖，烈火沖天，從熊熊燃燒的火山口冒出一個白色的蛋，随着蛋的開裂，滿天飛濺岩漿的同時鑽出了許多蚯蚓般的黑蟲子，他們一條條鑽進了附近成熟的西瓜裡。而這時發生了地震，而西瓜更奇怪，全部是中空的。而那些西瓜裡的蟲子進了五思的家并傷害了五思。而外面的火山繼續迸發着，并出現了一隻怪獸，而地上的蟲子向站着的人發起了襲擊。讓研究所幾乎全部陣亡，而外面的那隻怪獸終于現身了。在地面上大肆破壞着。而火山依然繼續迸發着，那蟲子居然變成了怪獸，為了保護上野，雲軒變身成雲山展開了自己的戰鬥，騰轉挪移，燕子飛踢，各種招式層出不窮，但卻因躲閃不及被蟲子所吐出的白色帶子束縛住。為了保護五思，雲山放棄了解除束縛。卻被折騰的精疲力盡。一直被那蟲子拖到角落。但還是死死保護着那名男孩。雲山終于将孩子拿在手中，擺脫了束縛，而後将孩子放在安全地方，為了救孩子卻中了巴頓的毒。危在旦夕，和怪獸凱姆吉拉展開了一場艱苦決戰的雲山，愕然的面對着面對這場危機的每個人，恐怖的兩大怪獸對決，雲山身陷危機。雲山的體力由于中毒大打折扣，被怪獸殺死，東京陷入一片恐慌，光太郎救回孩子，而兩個怪獸互毆起來，凱姆吉拉被巴頓食用。衆人很快找齊了所有的隊員，并向雲山敬禮，孩子們一直在叫着雲山這個名字，為了鏟除邪惡為和平而戰的雲山奧特曼，他那英勇的身姿深深刻在孩子們的心中。孩子們的祈禱聲彙成一股股清澈的波濤飄向遙遠的天際，迎來了奧特兄弟中的大哥佐菲。佐菲先對雲山用了奧特噴霧而後用了奧特光路将雲山捧起靜靜的返回天際。而雲軒則失蹤了。而光太郎則是和森山隊員一起前來看望五思并道歉。五思的媽媽原諒了大家，這時五思提到了雲軒哥哥，衆人頓時梗塞，原來雲軒目前為止一直下落不明可能已經死了。建一跑出來叫着雲軒的名字，可是僅僅隻看到幻影，而這邊五思的爸爸已經醒來了，火山怪鳥巴頓又襲擊了民航客機。ZAT決定去大熊火山進行調查。副隊長想到主意：用黏膠攻擊怪獸。可計劃失敗了，佐菲出現了，并展開戰鬥，佐菲的一記M87光線沒有消滅怪獸反而讓怪獸燒到了他的頭，因此有了炎頭隊長這個稱号。佐菲也因為躲閃不及而中毒。并犧牲了，而巴頓飛走了。雲山不在了，佐菲也戰敗了，還有誰能拯救危機呢？還有誰能幫助ZAT來抵抗火山怪鳥的侵襲呢？ZAT用盡了所有辦法，但行蹤不定的巴頓始終讓人難以接近。而ZAT則是電話不斷。而凡是有肉的地方都迎來了不速之客——巴頓，五思的媽媽抱怨着“這所有的一切都好怪ZAT隊他們不好”卻沒有任何人反駁。隻是提到奧特兄弟也是受害者。他們兄弟中的連性命都丢了。建一偷偷跑出來找雲軒，卻認錯了人。而此刻的雲山正在光之國接受治療。在母親的幫助下，雲山終于恢複健康了，“母親，我這是。”，“你差一點就失去了自己的生命。但是已經沒事了，快回去吧，回到地球上去吧。孩子們正在呼喚着你。這頂王冠送給你，作為你的新武器吧。”這時怪獸出現了，光太郎及時變身并與之大戰，可還是被打成重傷，這時已經恢複雲山終于趕到了，并幫助其救了建一，之後變回雲軒的模樣回到大家中間，聲稱是雲山奧特曼救了自己。而光太郎再次去看五思時。五思得媽媽卻變了臉色稱其是個怪物，走到哪怪獸就會出現在哪裡。将其趕走。于是ZAT決定去找唯一遺漏的地方。終于找到了巴頓。随後雲軒變身了，将戒指變大封住了巴頓的喙，又來到哥哥的身邊，将哥哥輕輕抱在懷裡，這時母親也來了和雲山一起将佐菲哥哥帶回了故鄉。